【短视频大赛】在线BLAST的使用

BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）,是生物信息学分析中最常用的工具之一，是用局部比对的方法在数据库中搜索与查询序列（query sequence）相似的序列。 根据查询的序列是核酸还是蛋白质及要搜索的数据库类型（核酸数据库或者蛋白质数据库。BLAST有不同的算法： Nucleotide BLAST，直接用核酸序列搜索核酸数据库。①blastn:直接是核酸的两两比对。②tblastx：将查询序列与核酸数据库中的所有序列都翻译成蛋白质，进行蛋白质的比对。 Protein BLAST，也称blastp。用蛋白序列去搜索蛋白质数据库。 blastx：用核酸序列去搜索蛋白质数据库，将核酸序列先翻译成蛋白质，再进行蛋白质的比对。 tblastn：用蛋白序列去搜索核酸数据库，把核酸数据库里的所有序列翻译成蛋白质序列，再继续蛋白质的比对。

出处：Bio-protocol第三届生物实验短视频大赛
作者：西北农林科技大学，潘希浪